Kaptenen på kustbevakningens plan är svårt skadad.

Kollisionen skedde när Japan Airlines-planet, som var på väg från Sapporo, var på väg att landa. Samtliga 379 ombord på passagerarplanet överlevde.

I en video från landningen syns öppna lågor från planets undersida efter att planet fattat eld.

Kustbevakningen uppger att myndighetens plan var på väg till staden Niigata för att leverera hjälp till den jordskalvsdrabbade provinsen Noto.

I klipp som sprids i sociala medier går det att se panikslagna passagerare som flyr undan elden.

En svensk familj befann sig ombord på det Japan Airlines-plan som började brinna på tisdagen, rapporterar Aftonbladet. Alla klarade sig utan skador.

– När det landade kollade jag ut genom fönstret. Det blev helt varmt. Sen kom brandbilar och började spruta på fönstret, säger 17-årige Anton Deibe som var i planet tillsammans med sina föräldrar och syster.

Under några minuter fylldes hela kabinen med rök innan nöddörrarna öppnades och passagerarna tog sig ut.

– Det var kalabalik. Vi är helt i chock allihopa. Jag tror inte vi fattat vad som hänt, säger Anton Deibe.

Alla flygplatsens övriga landningsbanor är tillfälligt avstängda.

Planet ska ha fattat eld i samband med att det kolliderat med ett flygplan som tillhör japanska kustbevakningen, rapporterar BNO News.

Enligt japanska kustbevakningen är det ett av deras plan som kolliderat med ett plan från Japan Airlines på flygplatsen, rapporterar BNO News.

Flyget är ett JAL 516 och har flugit från Hokkaido, rapporterar BBC.