Strejken inleddes vid midnatt och påverkar kort- och långdistansflygningar som avgår från tyska flygplatser. Den berör ungefär 100 000 passagerare.
Facket säger i ett uttalande att de planerar att förlänga strejken till 22.59 på torsdag, skriver TT.
Lufthansa och pilotfacket Vereinigung Cockpit har förhandlat i fyra år, vilket har lett till 14 strejker. Bakgrunden till den svåra och långdragna konflikten är att Lufthansa vill skära ner kostnaderna för att bättre kunna möta konkurrensen från dels lågprisbolag på den europeiska marknaden, dels från Gulfstatsbolagen på långdistansflygningarna.
Lufthansas ledning har erbjudit 2,5 procents löneförhöjning, medan facket kräver 3,7 procent under en femårsperiod. Förhandlingarna kollapsade samman tidigare denna månad.