Det är oklart exakt vad restriktionerna innebär. Fler regioner kan komma att omfattas framöver, enligt regeringen.
”Antalet fall ökar i aldrig tidigare skådad hastighet”, säger kabinettsministern Hirokazu Matsuno vid en presskonferens.
Omkring 80 procent av Japans befolkning har vaccinerat sig med två doser, men bara 1 procent med en tredje.