Rätten ska undersöka om kontraktet handlar om otillåtet företagsstöd och om det strider mot kommunallagen.
Enligt reklamavtalet får kommunen marknadsföra Nyköping på Ryanairs hemsida, i tidningsannonser, på flygplanen och på de destinationer Ryanair flyger till från Skavsta.
Den första delbetalningen på 40 miljoner har redan betalats ut.
Men kritiken mot avtalet är hård från oppositionspolitiker enligt Sörmlands Nyheter, eftersom avtalsförslaget hållits hemligt av kommunalrådet Göran Forssberg och kommunen tvingas låna pengar för att betala Ryanair.
Flygbolagen menar att inget flygbolag kan garantera att de kommer att upprättahålla en linje i tio år.
Ryanair granskas sedan tidigare av EU-kommissionen för att ha erhållit otillåtet regionalt stöd vid öppnandet av sin Charleroi-bas i Belgien.
Flygrevyn Express redaktör Bo Sehlberg menar att Ryanair lärt sig en läxa av detta och därför väljer att utforma ”subventioner” i form av ett reklamavtal för att undvika kritik om att flygbolaget erhåller formellt stöd, vilket är olagligt enligt EU:s regler.